Origin Pro
Applicazioni per la Farmacologia
Origin Pro è un software avanzato progettato per ottimizzare l’analisi dei dati in ambito farmacologico. Che si tratti di valutare i parametri dose-risposta, di adattare una curva standard o di eseguire un’analisi globale su più set di dati, Origin Pro contribuisce a rendere la tua analisi efficiente ed efficace.
Analisi dati per Farmacologia
Origin Pro supporta l’analisi dei dati farmacologici con numerose funzionalità integrate.
La piattaforma semplifica la valutazione dei parametri dose-risposta e il fitting di curve standard e globali. Grazie a strumenti dedicati, i ricercatori possono interpolare i dati per trovare concentrazioni sconosciute. Il software include numerosi modelli matematici nativi, tra cui le funzioni di Hill e sigmoidee.
Built-in Analysis Templates per l’analisi dose-risposta
Adattamento in un solo passaggio per curve standard e di risposta
Modelli per la generazione di una curva standard a partire dai dati del test
Global e replicate fitting di più set di dati
Modelli personalizzabili e strumento Batch Processing per automatizzare l’analisi di grandi volumi
Analisi dose-risposta
Un primo passo tipico nell’analisi dose-risposta (o concentrazione-risposta) consiste nell’adattare la risposta misurata di un sistema a diverse concentrazioni di un agonista, producendo una curva di controllo. Viene quindi introdotto un antagonista, vengono raccolti i dati di risposta e si esegue nuovamente l’adattamento. Il confronto tra le due curve di adattamento fornisce informazioni preziose sui complessi biochimici coinvolti nella risposta relativa dell’agonista in presenza dell’antagonista.
Lo strumento non-linear fitting di Origin Pro, NLFit, semplifica notevolmente analisi come quella dose-risposta, che si basa in gran parte sull’adattamento delle curve. Sebbene siano possibili molte relazioni funzionali, la maggior parte delle curve dose-risposta si adatta bene a una curva sigmoide. Origin Pro offre numerose funzioni di adattamento integrate:
- Dose Response, Biphasic Dose Response
- Logistic, 5-parameter Logistic, Sigmoidal Logistic (type 1, 2 and 3)
- Hill, Modified Hill
- Boltzmann, Transformed Boltzmann, Double Boltzmann
- One Site Binding, One Site Competition
- Two Site Binding, Two Site Competition
- Michalis Menten
- Gompertz
- Richards (type 1 and 2)
- Weibull (type 1 and 2)
Ma la tua analisi non si limita a queste, poiché NLFit ti permette di definire anche le tue funzioni di adattamento.
Curve Standard con Adattamento Replicato
Una curva standard fornisce la base per determinare i parametri sconosciuti a partire da un’interpolazione ben definita dei dati di risposta di un particolare sistema.
Una tipica curva standard viene generata da più esperimenti con intervalli di campionamento e valori dei parametri molto simili.
Invece di calcolare la media dei dati prima dell’interpolazione, operazione che può introdurre distorsioni statistiche, l’opzione di interpolazione replicata di Origin Pro (Concatenate Fit) consente di interpolare insieme i set di dati grezzi, ottenendo un’interpolazione complessiva migliore.
Origin Pro può quindi interpolare la curva standard per trovare i valori X (concentrazioni, ad esempio EC20 o EC80) a determinati valori Y, e viceversa. Utilizza il modello di analisi fornito con Origin Pro oppure progetta un modello personalizzato per automatizzare questa funzione.
Adattamento Globale per Set di Dati Multipli
Potrebbe essere necessario adattare i set di dati in modo indipendente o congiunto, utilizzando un adattamento globale e condividendo parametri come la linea di base o l’asintoto di risposta massima.
Origin Pro consente l’adattamento individuale e globale di più set di dati e permette di aggiungere o rimuovere facilmente dati dall’analisi.
Le capacità di Origin Pro nell’ambito dell’adattamento globale per l’analisi farmacologica sono dimostrato in un Caso di Studio sull’Adattamento Globale.
Esplorazione dei dati con il Quick Sigmodal Fit Gadget
Il Quick Sigmoidal Fit utilizza la regressione non lineare con una funzione sigmoide per adattare il dataset attivo. Analogamente al gadget Quick Fit, consente di adattare rapidamente diversi tipi di curve a un dataset per determinare quale sia la migliore. Allo stesso modo, è possibile utilizzare una funzione di adattamento simile per più dataset.
Sia Quick Fit and Quick Sigmoidal Fit sono strumenti estremamente utili per esplorare i dati prima di eseguire un’analisi completa. Quando si è pronti a passare alla fase successiva dell’analisi, i parametri e i risultati possono essere inviati direttamente allo strumento di adattamento non lineare (NLFit) di Origin Pro.
Adattamento ponderato per Dati mediati
A volte i dati della curva di risposta sono disponibili solo come dati medi con un certo margine di errore. I diversi metodi di adattamento ponderato di Origin Pro consentono di includere i valori di errore (o altri valori predefiniti) nell’adattamento.
Analisi in Batch dei dati dose-risposta
Una volta completata un’analisi, salvala come modello di analisi per poterla riutilizzare in seguito; basterà importare nuovi dati nel modello e l’analisi verrà completata automaticamente. Per chi dispone di grandi quantità di dati, è possibile utilizzare lo strumento di elaborazione batch di Origin Pro insieme al modello di analisi per automatizzare l’analisi dose-risposta.
User Case Studies
Sul sito OriginLab sono raccolti numerosi esempi applicativi in un’ampia gamma di discipline scientifiche; casi di studio condivisi dagli utenti di Origin Pro che quotidianamente apprezzano la potenza di analisi dei dati e la qualità nella creazione di grafici di cui hanno bisogno.
Questi Case Studies possono fornire idee e spunti su come utilizzare Origin Pro in modo efficiente per le specifiche esigenze.
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